| 黨委書記 | 張 榮 | 校長、黨委副書記 | 胡文平 |
| 黨委常務副書記 | 林東偉 | ||
| 黨委副書記 | 黃身勇 孫 理 | 副校長 | 方 穎 史大林 尤延鋮 |
| 吳超鵬 李智勇 | |||
| 紀委書記 | 黃身勇 | ||
| 黨委常委 | 張 榮 胡文平 林東偉 黃身勇 方 穎 尤延鋮 | ||
| 吳超鵬 孫 理 李智勇 高和榮 黎永強 | |||
| 校長助理 | 陳懷鋒 謝兆雄 紀榮嶸 | ||
校長、黨委副書記
胡文平 教授，中國科學院院士，國家杰出青年科學基金獲得者，教育部“長江學者獎勵計劃”特聘教授，博士生導師。
1970年5月出生，1993年湖南大學化學化工系本科畢業，1996年中國科學院金屬研究所（原金屬腐蝕與防護研究所）畢業并獲碩士學位，1999年中國科學院化學研究所畢業并獲博士學位。
研究方向：有機半導體物理化學。
黨委書記
張榮 教授，中國科學院院士，教育部“長江學者獎勵計劃”特聘教授，博士生導師，第十三、十四屆全國人大代表。
1964年2月出生，1983年南京大學物理學系本科畢業，1986年南京大學物理學系半導體專業碩士研究生畢業并獲碩士學位，1995年獲南京大學半導體專業博士學位。
研究方向：半導體光電子材料、器件和物理研究。
黨委常務副書記
林東偉
1970年8月出生，1992年7月廈門大學法律系本科畢業，2000年6月廈門大學財金系財政學專業在職研究生畢業并獲經濟學碩士學位。
研究方向：高教管理。
黨委副書記、紀委書記、國家監委駐廈門大學監察專員
黃身勇
1970年8月出生，1994年8月福建師范大學政教系本科畢業，2009年9月-2012年7月參加中央黨校研究生院經濟學（經濟管理）專業學習，中央黨校研究生學歷。
研究方向：高教管理。
黨委副書記
孫理
1970年10月出生，1993年7月廈門大學人類學系本科畢業，2001年7月廈門大學財政金融系金融學專業在職研究生畢業并獲經濟學碩士學位。
研究方向：高教管理。
副校長
史大林 教授，國家杰出青年科學基金獲得者，博士生導師。
1977年10月出生，2000年獲廈門大學生物學學士學位，2003年獲香港科技大學生物學碩士學位，2005年獲美國加州大學河濱分校環境科學碩士學位，2011年獲美國普林斯頓大學地球科學博士學位。
研究方向：海洋生物地球化學、海洋生態生理學。
黨委常委、副校長
周大旺 教授，教育部“長江學者獎勵計劃”特聘教授，國家杰出青年科學基金獲得者，博士生導師。
1976年1月出生，1998年獲廈門大學化學系學士學位，2002年獲美國紐約城市大學生化系理學碩士學位，2006年獲美國耶希瓦大學微生物學與免疫學博士學位。
研究方向：細胞生物學。
黨委常委、副校長
方穎 教授，教育部“長江學者獎勵計劃”特聘教授，國家杰出青年科學基金獲得者，博士生導師。
1973年3月出生，1996年復旦大學經濟學院經濟學系本科畢業，1999年復旦大學經濟學院經濟學系碩士研究生畢業并獲碩士學位，2006年獲美國匹茲堡大學經濟學博士學位。
研究方向：應用經濟學、統計學。
黨委常委、副校長
李智勇
1972年6月出生，1995年7月廈門大學生物系本科畢業，2002年7月廈門大學法律系法律專業在職研究生畢業并獲法律碩士學位。
研究方向：高教管理。
黨委常委、副校長
尤延鋮 教授，教育部“長江學者獎勵計劃”特聘教授，博士生導師。
1981年6月出生，2003年南京航空航天大學飛行器動力工程專業本科畢業，2008年南京航空航天大學航空宇航推進理論與工程專業博士研究生畢業并獲工學博士學位。
研究方向：空氣動力學、飛行器設計、航空發動機進排氣技術。
黨委常委、副校長
江云寶 教授，博士生導師。
1963年11月出生，1984年廈門大學化學系本科畢業，1987年廈門大學化學系研究生畢業并獲碩士學位，1990年獲廈門大學分析化學專業理學博士學位。
研究方向：分子識別與化學傳感，超分子光化學，電子轉移光物理，熒光光譜分析法。
黨委常委、副校長
吳超鵬 教授，教育部“長江學者獎勵計劃”特聘教授，博士生導師。
1979年6月出生，2001年華僑大學化學系本科畢業，2004年廈門大學財務管理碩士研究生畢業并獲管理學碩士學位，2009年獲廈門大學管理學博士學位。
研究方向：公司財務、資本市場與公司治理。
黨委常委、組織部長、教師工作部部長
孫理
1970年10月出生， 1993年7月廈門大學人類系本科畢業，2001年7月廈門大學財政金融系金融學專業在職研究生畢業并獲經濟學碩士學位。
研究方向：高教管理。
黨委常委、副校長
邱偉杰
1971年7月出生，1992年7月廈門大學法律系本科畢業，2002年7月廈門大學法律系民商法學在職研究生畢業并獲法學碩士學位。
研究方向：民商法學。
校長助理
張建霖 教授
1965年3月出生，1984年西北工業大學飛機系本科畢業，1987年西北工業大學固體力學專業畢業并獲碩士學位，2011年西北工業大學工程力學專業畢業并獲博士學位。
研究方向：建筑結構工程、結構動力學
領導分工：協助分管基建工作
校長助理
陳光
1964年4月出生，1986年7月廈門大學政治經濟學專業本科畢業。
研究方向：高教管理。
領導分工：協助分管翔安校區工作。